Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB3P28472 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRB3P28472 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms