Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU1F1P28069 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU1F1P28069 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms