Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNTFRP26992 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFRP26992 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms