Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMGB2P26583 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms