Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA4P25789 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms