Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHCGRP22888 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms