Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA1P22314 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBA1P22314 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA1P22314 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA1P22314 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA1P22314 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms