Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VDAC1P21796 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VDAC1P21796 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms