Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT1P21579 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms