Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC3P19447 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC3P19447 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms