Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XBP1P17861 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XBP1P17861 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XBP1P17861 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XBP1P17861 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XBP1P17861 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms