Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms