Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN1P17600 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYN1P17600 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN1P17600 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYN1P17600 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms