Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GNB3P16520 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GNB3P16520 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms