Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB1P16220 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB1P16220 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms