Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD44P16070 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD44P16070 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD44P16070 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD44P16070 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms