Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA1P14867 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms