Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRF1P14222 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRF1P14222 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms