Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms