Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms