Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC5P13010 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC5P13010 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms