Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGF3P11487 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FGF3P11487 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FGF3P11487 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGF3P11487 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGF3P11487 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms