Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms