Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2P10911 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCF2P10911 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCF2P10911 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCF2P10911 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms