Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PF4V1P10720 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms