Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms