Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0C879 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0C879 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0C879 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P0C879 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P0C879 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P0C879 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0C879 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0C879 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0C879 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms