Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIL1P09327 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIL1P09327 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIL1P09327 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIL1P09327 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIL1P09327 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms