Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDHBP07195 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDHBP07195 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms