Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTNP04004 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTNP04004 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTNP04004 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTNP04004 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VTNP04004 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VTNP04004 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms