Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms