Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED1O96006 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED1O96006 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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