Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNTO95613 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNTO95613 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNTO95613 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCNTO95613 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNTO95613 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms