Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4AO95239 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms