Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPO95166 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms