Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM2O94769 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms