Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLOT1O75955 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms