Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA2O75334 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA2O75334 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms