Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG13O75143 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG13O75143 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG13O75143 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG13O75143 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG13O75143 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG13O75143 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG13O75143 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG13O75143 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG13O75143 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG13O75143 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms