Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNND1O60716 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNND1O60716 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms