Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms