Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SPAG9O60271 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPAG9O60271 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms