Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA5O60264 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms