Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms