Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms