Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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