Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBFA2T2O43439 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBFA2T2O43439 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms