Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF3O43395 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms