Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRXO43186 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRXO43186 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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