Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms